Bacillus Subtilis Neden Bu Kadar Yaygın Olarak Kullanılıyor? 3. BÖLÜM
"Son yıllardaki çalışmalar, neyin ne olduğuna dair görüşümüzü değiştirdi. B. subtilis hayvanların GI yolu içinde yapabilir. Geçmişte, B. subtilis çoğunlukla anaerobik olan GI yolundan bir spor olarak geçen zorunlu bir aerob olduğu düşünülüyordu. Bu nedenle, tüketiminden kaynaklanan herhangi bir yararın, sporun bazı içsel özelliklerinden kaynaklandığı düşünülüyordu. Ancak son kanıtlar şunu gösteriyor: B. subtilis tamamını tamamlayabiliryaşam döngüsü spordan vejetatif hücreye giden ve tekrar sporlanan GI yolu içinde. Aslında, GI yolu içindeki büyüme, aşağıdakiler gibi patojenleri geride bırakabilecek kadar sağlam olmalıdır: E. coli oral olarak uygulandığında kanatlı GI kanallarında." Özetle, mevcut veriler şunu gösteriyor: B. subtilis' belirgin her yerde bulunma, yalnızca bu ortamlarda spor kalıcılığının bir sonucu değildir. Yerine B. subtilis toprak, bitki kökleri ve hayvanların GI yolu dahil olmak üzere çeşitli ortamlarda büyüdüğü görülmektedir. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Bugün, büyük miktarlarda sekans bilgisinin üretilmesi, birleştirilmesi ve analiz edilmesi için giderek daha kolay hale gelen yöntemler sayesinde kendimizi genomik altın çağında buluyoruz. 23. Bir türün ekolojisinin bir resmini elde etmek için artık yalnızca izolasyon coğrafyasına, laboratuvardaki davranışlara veya anekdot niteliğindeki raporlara güvenmemize gerek yok. Ek olarak, ilgili herhangi bir suşta bulunan veya bulunmayan genleri araştırabiliriz. Bir organizmanın genomunda kodlandığı tahmin edilen proteinlerin kimliği, o organizmanın yaşam tarzı ve yaşadığı habitatlar hakkında çok şey ortaya çıkarabilir. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Son olarak, dönüşümün gerçekten de evrimi yönlendirmeye yardımcı olabileceği görülüyor. B. subtilis. Laboratuvar koşullarında suşlar, akrabalarından eksojen olarak eklenen genomik DNA'yı alıp yeniden birleştirebilir. 58. Bu, alt türler arasında bile meydana gelebilir, ancak akrabalık azaldıkça rekombinantların sayısı azalır, bu fenomen cinsel izolasyon olarak adlandırılır. 58. Ayrıca sterilize edilmiş toprak mikro kozmoslarını kullanan erken deneyler, suşların farklı "işaretli" varyantları karıştırıldığında ne olduğunu izledi. 59. Bu tür bir değiş tokuş, örneğin farklı türler arasında bile gözlemlendi. B. subtilis Ve B. licheniformis 60. Bununla birlikte, kullanılan her iki laboratuvar suşunun da vahşi suşlara göre çok daha fazla dönüştürülebilir olduğu bilindiğinden, gözlemlenen sonuçlar muhtemelen suşların seçiminde yanlı olmuştur. "Hibrit türler" rekombinantları da kararsızdı, bu da sonuçların doğada meydana gelenlerle ilgili olmayabileceğini düşündürüyor. Bununla birlikte, öyle görünüyor ki, vahşi popülasyonlar B. subtilis gerçekten de genlerini doğada yeniden birleştiriyor mu? 30. Bu değiş tokuşa nasıl aracılık edildiği - dönüşüm, transdüksiyon veya konjugasyon yoluyla - henüz belirlenmemiştir. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Özetle, B. subtilis toprak, bitki kökleri ve hayvanların GI yolları dahil olmak üzere sayısız ortamda büyüyebilen, geniş çapta adapte olmuş bir bakteri türüdür. bu B. subtilis 168 genom dizisi, bu ortamlardan bazılarında büyümenin nasıl mümkün olduğunu anlamamıza yardımcı olan önemli bir araç olmuştur. Ancak artık anlaşılmıştır ki, B. subtilis 168 genomu tüm hikayeyi anlatmaz. M-CGH analizleri, türün farklı üyelerinin genleri arasında büyük değişkenlik olduğunu ortaya koymuştur. (Earl, Losick, Kolter, 2008).
Earl, AM, Losick, R. ve Kolter, R. (2008). Bacillus subtilis'in ekolojisi ve genomiği. Mikrobiyolojide Trendler, 16(6), 269–275. https://doi.org/10.1016/j.tim.2008.03.004.
